L’analyse de séquençage métagénomique identifie des signatures microbiennes intestinales transversales associées à la dégénérescence maculaire liée à l’âge

MEDICAL RETINA Guangzhou – Des altérations du microbiote intestinal sont associées à la dégénérescence maculaire liée à l’âge (DMLA). Cependant, les dysbioses communes à différents groupes ethniques et géographiques, susceptibles d’être associées à la pathogenèse de la maladie, restent sous-explorées. L’objectiv de Wei Xue et al. du Centre Ophtalmologique de Zhongshan de l’université Sun Yat-sen, à Guangzhou, Chine, étant de caractériser la dysbiose du microbiote intestinal chez des patients atteints de DMLA, issus de cohortes chinoises et suisses et d’identifier des signatures de cohortes croisées associées à la DMLA, le groupe de chercheurs a réalisé un séquençage métagénomique par shotgun sur des échantillons de selles de 30 patients atteints de Dégénérescence Maculaire Liée à l’Âge (DMLA ) et de 30 sujets sains et a réanalysé des ensembles de données publiés, comprenant 138 échantillons de patients suisses atteints de DMLA et de sujets sains. Un profilage taxonomique complet a été effectué par comparaison avec la base de données du génome (RefSeq), la base de données du génome assemblé par métagénome (MAG) et la base de données des viromes intestinaux (Gut Virome Database, GVD). Le profilage fonctionnel a été obtenu par reconstruction des voies (MetaCyc). La diversité α du microbiote du tube digestif était réduite chez les patients atteints de DMLA selon les profils taxonomiques générés en recourant à la base de données MAG comme référence, mais pas à celle de RefSeq. Le rapport Firmicutes/Bacteroidetes était également inférieur chez les patients atteints de DMLA. Parmi les bactéries associées à la DMLA partagées entre les cohortes chinoises et suisses, Ruminococcus callidus, Lactobacillus gasseri et Prevotellaceae (f) uSGB 2135 étaient enrichies chez les patients atteints de DMLA, tandis que Bacteroidaceae (f) uSGB 1825 était appauvri chez les patients atteints de DMLA et était négativement associé à la taille de l’hémorragie. Bacteroidaceae était l’un des principaux hôtes des phages associés à la DMLA. Trois série d’étapes de dégradation ont été moins actives dans la DMLA. Les auteurs concluent dans le numèro de mai 2023 du journal scientifique INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE, que ces résultats démontrent une association entre la dysbiose du microbiote intestinal et la DMLA.. Aussi ont-ils identifié des signatures microbiennes intestinales transversales impliquant des bactéries, des virus et des voies métaboliques, susceptibles de constituer des pistes prometteuses dans la prévention ou le traitement de la DMLA. (um)

Auteurs : Xue W, Peng P, Wen X, Meng H, Qin Y, Deng T, Guo S, Chen T, Li X, Liang J, Zhang F, Xie Z, Jin M, Liang Q, Wei L. Correspondance : Lai Wei, School of Pharmaceutical Sciences, Southern Medical University, Shatai North Road, Guangzhou 510000, China. Electronic address : laiwei@smu.edu.cn Étude : Metagenomic Sequencing Analysis Identifies Cross-Cohort Gut Microbial Signatures Associated With Age-Related Macular Degeneration. Source : Invest Ophthalmol Vis Sci. 2023 May 1;64(5):11. doi: 10.1167/iovs.64.5.11. PMID: 37195657; PMCID: PMC10202153. Web : https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2785626